環境資源科学研究センター 代謝環境酵素学理研ECL研究ユニット
理研ECL研究ユニットリーダー 千葉 洋子（Ph.D.）
研究概要
代謝は生命を生命たらしめる主要なメカニズムです。当研究ユニットは、多様な生物の有する代謝・酵素の比較解析を通じて、代謝設計原理の解明を目指します。具体的には、いわゆるモデル生物とは異なる環境に適応した生物の有する未知の中心的代謝経路を明らかにするとともに、なぜそのような違いが生じたのかを生物の生息する環境や細胞内の物理化学的な条件および「代謝的な文脈」を考慮することで探求します。これにより、生命を40億年持続させてきたメカニズム代謝という観点で明文化し、人類の持続可能な社会活動に役立てます。
研究主分野
- 総合生物
研究関連分野
- 化学
- 農学
- 生物学
- 応用微生物学
- 応用生物化学
- 機能生物化学
キーワード
- 代謝
- 微生物
- 酵素
- 非モデル生物
- 動力学
主要論文
「*」は、理研外のみでの成果です。
- 1.
Chiba, Y., Ooka, H.:
"How to enhance enzymatic reaction rates? The Sabatier principle and beyond"
Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry, 90, 300-305 (2026) - 2.
Wakashima, T., Kume, K., Chiba, Y.:
"Wood-Ljungdahl pathway and the reductive glycine pathway in Desulfobacterota"
Frontiers in Microbiology 16, 1708584 (2026) - 3.
Chiba, Y., Sumida, T., Kameya, M., Fukuyama, Y., Wakashima, T., Shimamura, S., Kamikawa, R., Chikaraishi, Y., Nunoura, T.:
"Impact of acetate on CO2 fixation pathways in thermophilic and hydrogenotrophic bacteria"
ISME communications 5, ycaf227 (2025) - 4.
Chiba, Y., Ooka, H., Wintzer, M. E., Tsunematsu, N., Nogawa, T., Suzuki, T., Dohmae, N., Nakamura, R.:
"Rationalizing the influence of the binding affinity on the activity of phosphoserine phosphatases"
Angewandte Chemie International Edition 63, e202318635 (2024) - 5.
Ooka, H., Chiba, Y., Nakamura, R.:
"Thermodynamic principle to enhance enzymatic activity using the substrate affinity"
Nature Communications 14, 4860 (2023) - 6.
*Chiba, Y., Yoshida, A., Shimamura, S., Kameya, M., Tomita, T., Nishiyama, M., Takai, K.:
"Discovery and analysis of a novel type of the serine biosynthetic enzyme phosphoserine phosphatase in Thermus thermophilus"
The FEBS Journal 286, 726-736 (2019) - 7.
*Kim, K., Chiba, Y., Kobayashi, A., Arai, H., Ishii, M.:
"Phosphoserine phosphatase is required for serine and one-carbon unit synthesis in Hydrogenobacter thermophilus"
Journal of bacteriology 199, 10.1128/jb. 00409-00417 (2017) - 8.
*Chiba, Y., Kamikawa, R., Nakada-Tsukui, K., Saito-Nakano, Y., Nozaki, T.:
"Discovery of PPi-type phosphoenolpyruvate carboxykinase genes in eukaryotes and bacteria"
Journal of Biological Chemistry 290, 23960-23970 (2015) - 9.
*Chiba,Y., Oshima, K., Arai, H., Ishii, M., Igarashi, Y.:
"Discovery and analysis of cofactor-dependent phosphoglycerate mutase homologs as novel phosphoserine phosphatases in Hydrogenobacter thermophilus"
Journal of Biological Chemistry 287, 11934-11941 (2012) - 10.
*Chiba, Y., Terada, T., Kameya, M., Shimizu, K., Arai, H., Ishii, M., Igarashi, Y.:
"Mechanism for folate‐independent aldolase reaction catalyzed by serine hydroxymethyltransferase"
The FEBS Journal 279, 504-514（2012）
関連リンク
- 千葉代謝環境酵素学理研ECL研究ユニット（開拓研究所）
- 代謝環境酵素学理研ECL研究ユニット｜環境資源科学研究センター
- 代謝環境酵素学理研ECL研究ユニットホームページ
- 2024年8月1日クローズアップ科学道 研究最前線「酵素活性を自在に変えられるのか」
メンバーリスト
主宰者
- 千葉 洋子
- 理研ECL研究ユニットリーダー
採用情報
| 募集職種 | 応募締切 |
|---|---|
| 研究員または特別研究員募集（25-1655） | ポストが決まり次第 |
お問い合わせ先
〒351-0198埼玉県和光市広沢2番1号
環境資源科学研究棟
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