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環境資源科学研究センター分子リガンド標的研究チーム

チームディレクター BOONE Charles（Ph.D.）

English Page

研究概要

ユニークな生理活性を示す小分子リガンドには、生体内に必ず特異的な標的分子が存在します。標的分子の決定は、分子リガンドの作用機構解明に必須であり、創薬研究の要ともなっています。しかし、分子リガンドと標的分子との相互作用は一様でないため、これまで標的分子の決定はきわめて困難でした。当チームは、酵母の遺伝子破壊株ライブラリーや遺伝子過剰発現株ライブラリーを用いた遺伝学的相互作用の検出法をもとにした新しい相互作用検出技術の開発を行います。これを用いて生理活性を引き出す原因となる標的分子を速やかにかつ正確に決定することを目指します。

研究主分野

生物学

研究関連分野

医歯薬学

キーワード

ケミカルゲノミクス
標的同定
酵母

主要論文

1. Obara, K., Okada, H., Tan, G., Ohnuki, S., Suzuki, G., Ohtake, H., Kubo, K., Ghanegolmohammadi, F., Ishizaka, S., Yashiroda, Y., Okita, A., Mishiro-Sato, E., Suzuki, K., Tamura, Y., Ashine, R., Ikeda, Y., Kamura, T., van Leeuwen, J., Andrews, B., Bi, E., Noda, N. N., Boone, C., Ohya, Y.:
"Role of Pbr1, a putative oxidoreductase, in the ER quality control and folding of yeast Fks1 glucan synthase"
Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 123, e2612792123 (2026)
2. Dutta, A., Garin, M., Loegler, V., Brach, G., Friedrich, A., Yoshimura, M., Hirano, H., Osada, H., Boone, C., Yashiroda, Y., Hou, J., Schacherer, J.:
"Population-scale chemical response revealed by a barcoded yeast collection"
Nat. Commun., 17, 6928 (2026)
3. Billmann, M., Costanzo, M., Zhang, X., Hassan, AZ., Rahman, M., Brown, KR., Chan, KSY., Tong, AHY., Pons, C., Ward, HN., Ross, C., van Leeuwen, J., Aregger, M., Lawson, KA., Mair, B., Roth, AF., Sen, NE., Forster, DT., Tan, G., Mero, P., Masud, SN., Lee, Y., Aguilera-Uribe, M., Ušaj, M., Almeida, SMT., Aulakh, K., Bhojoo, U., Birkadze, S., Budijono, N., Cai, X., Caumanns, JJ., Chalmers, JJ., Chandrashekhar, M., Chang, D., Climie, R., Dasgupta, K., Drazic, A., Echenique, JIR., Gacesa, R., Farias, AG., Habsid, A., Horecka, I., Kantautas, K., Ji, F., Kim, DK., Lee, SY., Liang, W., Lim, HJ., Lin, K., Lu, X., Maier, M., Nami, B., Nixon, A., Mikolajewicz, N., Mokhtaridoost, M., Nedyalkova, L., Rohde, T., Rodrigues, MS., Soste, M., Schultz, E., Wang, W., Seetharaman, A., Shuteriqi, E., Sizova, O., Taylor, DT., Tereshchenko, M., Tieu, D., Turowec, J., Ubhi, T., Varland, S., Wang, KE., Wang, ZY., Wei, J., Xiao, YX., Maass, PG., Reversade, B., Brown, GW., Cravatt, BF., Dixon, SJ., Wyatt, HDM., Röst, HL., Roth, FP., Xia, T., Bader, GD., Loewith, R., Davis, NG., Andrews, B., Myers, CL., Moffat, J., Boone, C.:
"Global genetic interaction network of a human cell maps conserved principles and informs functional interpretation of gene co-essentiality profiles"
Cell, 189(12), 3736-3759.e58 (2026)
4. Li, ST., Kamada, K., Honda, A., Seino, J., Matsuda, T., Suzuki, T., Dohmae, N., Shichino, Y., Iwasaki, S., Noda, Y., Costanzo, M., Boone, C., Suzuki, T.:
"LLP1 is a pyrophosphatase involved in homeostasis/quality control of dolichol-linked oligosaccharide"
J. Cell Biol., 224(11), e202501239 (2025)
5. Diehl, C., Pinzan, CF., de Castro, PA., Delbaje, E., García Carnero, LC., Sánchez-León, E., Bhalla, K., Kronstad, JW., Kim, D-g., Doering, TL., Alkhazraji, S., Mishra, NN., Ibrahim, AS., Yoshimura, M., Vega Isuhuaylas, LA., Pham, LTK., Yashiroda, Y., Boone, C., Dos Reis, TF., Goldman, GH.:
"Brilacidin, a novel antifungal agent against Cryptococcus neoformans"
mBio, 15, e0103124 (2024)
6. Iyer, KR., Li, SC., Revie, NM., Lou, JW., Duncan, D., Fallah, S., Sanchez, H., Skulska, I., Ušaj, MM., Safizadeh, H., Larsen, B., Wong, C., Aman, A., Kiyota, T., Yoshimura, M., Kimura, H., Hirano, H., Yoshida, M., Osada, H., Gingras, AC., Andes, DR., Shapiro, RS., Robbins, N., Mazhab-Jafari, MT., Whitesell, L., Yashiroda, Y., Boone, C., Cowen, LE.:
"Identification of triazenyl indoles as inhibitors of fungal fatty acid biosynthesis with broad- spectrum activity"
Cell Chem. Biol., 30, 795-810 (2023)
7. Forster, DT., Li, SC., Yashiroda, Y., Yoshimura, M., Li, Z., Isuhuaylas, LAV., Itto-Nakama, K., Yamanaka, D., Ohya, Y., Osada, H., Wang, B., Bader, GD., Boone, C.:
"BIONIC: biological network integration using convolutions"
Nat. Methods, 19, 1250-1261 (2022)
8. Persaud, R., Li, SC., Chao, JD., Forestieri, R., Donohue, E., Balgi, AD., Zheng, X., Chao, JT., Yashiroda, Y., Yoshimura, M., Loewen, CJR., Gingras, AC., Boone, C., Av-Gay, Y., Roberge, M., Andersen, RJ.:
"Clionamines stimulate autophagy, inhibit Mycobacterium tuberculosis survival in macrophages, and target Pik1"
Cell Chem. Biol., 29, 870-882 (2021)
9. Tomita, K., Yashiroda, Y., Matsuo, Y., Piotrowski, JS., Li, SC., Okamoto, R., Yoshimura, M., Kimura, H., Kawamura, Y., Kawamukai, M., Boone, C., Yoshida, M., Nojiri, H., Okada, K.:
"Genome-wide screening of genes associated with momilactone B sensitivity in the fission yeast Schizosaccharomyces pombe"
G3 (Bethesda), 11, jkab156 (2021)
10. Piotrowski, JS., Li, SC., Deshpande, R., Simpkins, SW., Nelson, J., Yashiroda, Y., Barber, JM., Safizadeh, H., Wilson, E., Okada, H., Gebre, AA., Kubo, K., Torres, NP., LeBlanc, MA., Andrusiak, K., Okamoto, R., Yoshimura, M., van Leeuwen, J., Shirahige, K., Baryshnikova, A., Brown, GW., Hirano, H., Costanzo, M., Andrews, B., Ohya, Y., Osada, H., Yoshida, M., Myers, CL., and Boone, C.:
"Functional annotation of chemical libraries across diverse biological processes"
Nat. Chem. Biol., 13, 982-993 (2017)