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生命機能科学研究センター AI生物学研究チーム

チームディレクター 尾崎 遼（Ph.D.）

研究概要

尾崎 遼

私たちは、AI生物学により、生命科学の研究現場に「AIやロボットが当たり前にある日常」をつくることを目指しています。開発・実装や生命科学研究での応用・検証を通じ、AIやロボットといった非人間によって初めてアプローチできる様々な可能性を実証し、さらには理論化・学問化を志向していきます。

研究主分野

  • 複合領域

研究関連分野

  • 情報学
  • 総合生物
  • 生物学
  • 生命、健康および医療情報学関連
  • システムゲノム科学関連

キーワード

  • AI生物学
  • 実験自動化
  • 研究自動化
  • 細胞インフォマティクス

主要論文

「*」は、理研外のみでの成果です。

  • 1. *Matsuzawa R, Kawahara D, Kashima M, et al.
    "tomoseqr: A Bioconductor package for spatial reconstruction and visualization of 3D gene expression patterns based on RNA tomography."
    PLOS ONE 20(1), e0311296 (2025) doi: 10.1371/journal.pone.0311296
  • 2. *Nakata S, Iwasaki K, Funato H, et al.
    "Neuronal subtype-specific transcriptomic changes in the cerebral neocortex associated with sleep pressure."
    Neuroscience Research 207, 13-25 (2024) doi: 10.1016/j.neures.2024.03.004
  • 3. *Tahara S, Tsuchiya T, Matsumoto H, Ozaki H.
    "Transcription factor-binding k-mer analysis clarifies the cell type dependency of binding specificities and cis-regulatory SNPs in humans."
    BMC Genomics 24(1), 597 (2023) doi: 10.1186/s12864-023-09692-9
  • 4. Arai Y, Takahashi K, Horinouchi T, et al.
    "SAGAS: Simulated annealing and greedy algorithm scheduler for laboratory automation."
    SLAS Technology 28(4), 264-277 (2023) doi: 10.1016/j.slast.2023.03.001
  • 5. *Tsuchiya T, Hori H, Ozaki H.
    "CCPLS reveals cell-type-specific spatial dependence of transcriptomes in single cells."
    Bioinformatics 38(21), 4868-4877 (2022) doi: 10.1093/bioinformatics/btac599
  • 6. Itoh TD, Horinouchi T, Uchida H, et al.
    "Optimal Scheduling for Laboratory Automation of Life Science Experiments with Time Constraints."
    SLAS Technology 26(6), 650-659 (2021) doi: 10.1177/24726303211021790
  • 7. *Minoshima F, Ozaki H, Odaka H, Tateno H.
    "Integrated analysis of glycan and RNA in single cells."
    iScience 24(8), 102882 (2021) doi: 10.1016/j.isci.2021.102882
  • 8. Ozaki H, Hayashi T, Umeda M, Nikaido I.
    "Millefy: visualizing cell-to-cell heterogeneity in read coverage of single-cell RNA sequencing datasets."
    BMC Genomics 21(1), 177 (2020) doi: 10.1186/s12864-020-6542-z

研究成果（プレスリリース）

メンバーリスト

主宰者

尾崎 遼
チームディレクター

メンバー

早川 慶紀
研究員
田原 沙絵子
研究生
仮屋山 博文
特別研究員
宮西 和也
学振特別研究員PD
知念 優
研究パートタイマーⅠ
松山 昌平
研究パートタイマーⅠ
田原 悠也
研修生
松澤 亮輔
研修生
石橋 遼
研修生
井尻 遥士
研修生
今井 淳之介
研修生
橘 晃生
研修生
安田 千七
研修生
德永 光治
研修生
木村 紗季
研修生
坂口 義彦
研修生
中本 千香
研修生
蓮見 正成
研修生
長谷川 森雄
研修生
神田 元紀
客員主管研究員
エルハラル 美和
アシスタント

採用情報

募集職種 応募締切
研究員または特別研究員またはリサーチアソシエイト募集（25-2456） ポストが決まり次第
上級テクニカルスタッフまたはテクニカルスタッフⅠ募集（25-2459） ポストが決まり次第
研究パートタイマーⅠまたは研究パートタイマーⅡ募集（25-2460） ポストが決まり次第
研究パートタイマーⅠまたは研究パートタイマーⅡ募集（25-511） ポストが決まり次第

お問い合わせ先

〒650-0047 兵庫県神戸市中央区港島南町6-7-1
融合連携イノベーション推進棟
Email: ai-biology@ml.riken.jp

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