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環境資源科学研究センター創薬シーズ開拓基盤ユニット

ユニットリーダー吉田稔（D.Agr.）

English Page

研究概要

当ユニットは、多様性に富んだ天然化合物ライブラリーや目的志向型のフォーカストライブラリーを用いたハイスループットスクリーニングを実施するための適切な評価系と機器システムをプラットフォームとして確立するとともに、計算化学や創薬化学と連携してアカデミア創薬に貢献することをミッションとしています。加えて、新規創薬標的の開拓と妥当性検証を実施するため、実験自動化、データ管理のDX化、類似構造ネットワークに基づくクラスタリング解析やAIによる化合物探索技術を導入して次世代型創薬技術の発展に貢献することを目指します。

研究主分野

生物学

研究関連分野

化学
情報学

キーワード

ケミカルバイオロジー
エピジェネティクス
作用機作
遺伝子発現制御
創薬スクリーニング

主要論文

1. Hoshikawa, Y., Shirota, N., Tsugawa, H., Kimura, S., Matsuyama, A., Yashiroda, Y., Kakeya, H., Arita, M., Iizumi, R., Yoshida, M., Nishimura, S.:
"Formation of giant ER sheets by pentadecanoic acid causes lipotoxicity in fission yeast."
Proc. Natl. Acad. Sci U. S. A. 122(22):e2422126122 (2025)
2. Schneider-Poetsch, T., Dang, Y., Iwasaki, W., Arata, M., Shichino, Y., Al Mourabit, A., Moriou, C., Romo, D., Liu, J.O., Ito, T., Iwasaki, S., Yoshida, M.:
"Girolline is a sequence context-selective modulator of eIF5A activity."
Nat. Commun. 16(1):223 (2025)
3. Noritsugu, K., Suzuki, T., Dodo, K., Ohgane, K., Ichikawa, Y., Koike, K., Morita, S., Umehara, T., Ogawa, K., Sodeoka, M., Dohmae, N., Yoshida, M., Ito, A.:
"Lysine long-chain fatty acylation regulates the TEAD transcription factor."
Cell Rep. 42(4), 112388 (2023)
4. Takase, S., Hiroyama, T., Shirai, F., Maemoto, Y., Nakata, A., Arata, M., Matsuoka, S., Sonoda, T., Niwa, H., Sato, S., Umehara, T., Shirouzu, M., Nishigaya, Y., Sumiya, T., Hashimoto, N., Namie, R., Usui, M., Ohishi, T., Ohba, S., Kawada, M., Hayashi, Y., Harada, H., Yamaguchi, T., Shinkai, Y., Nakamura, Y., Yoshida, M., Ito, A.:
"A specific G9a inhibitor unveils BGLT3 lncRNA as a universal mediator of chemically induced fetal globin gene expression."
Nat. Commun. 14, 23 (2023)
5. Sasaki, K., Suzuki, M., Sonoda, T., Schneider-Poetsch, T., Ito, A., Takagi, M., Fujishiro, S., Sohtome, Y., Dodo, K., Umehara, T., Aburatani, H., Shin-ya, K., Nakao, Y., Sodeoka, M., Yoshida, M.:
"Visualization of the dynamic interaction between nucleosomal histone H3K9 tri-methylation and HP1α chromodomain in living cells."
Cell Chem. Biol. 29(7), 1153-1161.e5. (2022)
6. Chhipi-Shrestha, J.K., Schneider-Poetsch, T., Suzuki, T., Mito, M., Khan, K., Dohmae, N., Iwasaki, S., Yoshida, M.:
"Splicing modulators elicit global translational repression by condensate-prone proteins translated from introns."
Cell Chem. Biol. 29(2), 259-275 (2022)
7. Yoshimoto, R., Chhipi-Shrestha, J.K., Schneider-Poetsch, T., Furuno, M., Burroughs, A.M., Noma, S., Suzuki, H., Hayashizaki, Y., Mayeda, A., Nakagawa, S., Kaida, D., Iwasaki, S., Yoshida, M.:
"Spliceostatin A interaction with SF3B1 limits U1 snRNP availability and causes premature cleavage and polyadenylation."
Cell Chem. Biol. 28(9), 1356-1365.e4. (2021)
8. Kobayashi, H., Hatakeyama, H., Nishimura, H., Yokota, M., Suzuki, S., Tomabechi, Y., Shirouzu, M., Osada, H., Mimaki, M., Goto, Y., Yoshida, M.:
"Chemical reversal of abnormalities in cells carrying mitochondrial DNA mutations."
Nat. Chem. Biol. 17(3), 335-343 (2021)
9. Schneider-Poetsch, T., Yoshida, M.:
"Along the central dogma-controlling gene expression with small molecules."
Annu. Rev. Biochem. 87, 391-420 (2018)
10. Piotrowski, J.S., Li, S.C., Deshpande, R., Simpkins, S.W., Nelson, J., Yashiroda, Y., Barber, J.M., Safizadeh, H., Wilson, E., Okada, H., Gebre, A.A., Kubo, K., Torres, N., Leblanc, M.B., Andrusiak, K., Okamoto, R., Yoshimura, M., van Leeuwen, J., Shirahige, K., Baryshnikova, A., Brown, G., Saito, T., Costanzo, M., Andrews, B., Ohya, Y., Osada, H., Yoshida, M., Myers, C.L., Boone, C.:
"Functional annotation of chemical libraries across diverse biological processes."
Nat. Chem. Biol. 13(9), 982-993 (2017)